Файловые менеджеры: 
iCommander (Cydia) - простой менеджер, открывающий как mobile, так и root, то есть системную область, позволяет изменять права. Позволяет свободно перемещаться по файловой системе iPhone, перемещать файлы и изменять атрибуты (права доступа). С помощью этого файлового менеджера можно легко и удобно выставить права 755, что часто требуется при установке на iPhone сторонних программ. Программа iCommander доступна в Cydia.

Mobile Finder (Cydia) - многофункциональный менеджер: копирование, перемещение, удаление файлов, запуск приложений, смена прав, открывает всю файловую систему.

iFiles (Cydia) - отличный файл менеджер, умеет почти все: создает и удаляет папки и файлы, устанавливает права, открывает документы и медиафайлы и т.д.

Есть еще несколько файловых менеджеров из Апп Стора, но они естественно дают доступ только в пользовательский раздел mobile, что для многих достаточно и даже полезно. Если вы не до конца понимаете, что вы удаляете или перемещаете, лучше не ставьте себе эти программы вовсе.

Чтения книг и создания документов: 
RuBooks (Cydia)- программа для чтения книг, понимает fb2, txt, html, xls, doc, pdf, читает файлы из любой папки.

BookReader (Cydia) - HTML читалка

TextReader (Cydia) - программа для чтения больших текстов и файлов Palm doc, pdb

Docs (AppStore) - читает PDF, World, Exel, Powerpoint и др.

Spreadsheet (AppStore) - открывает, создает и редактирует файлы Excel !

TextGuru (AppStore) - текстовый редактор, создает и редактирует *.txt и читает *.doc, *.xls, *.xml, и др.

BookShelf (AppStore) - мультиформатная читалка - *.txt, *.html, *.fb2, *.pdb,*.pdb,*.prc,*.mobi,*.pdb,*.chm,*.mht,*.rtf, *.doc (Word 97+), извлекает поддерживаемые форматы из ZIP.

ReaddleDocs (AppStore) - читает Microsoft Office Word (DOC, docx), Excel (XLS, xlsx), PowerPoint (PPT, pptx). И главное - сохраняет HTML страницы и позволяет просматривать их в оффлайне.

ShortBook (AppStore) - одна из лучших читалок FB2 с возможностью закачки прямо из инета в форматах FB2 или ZIP. Русифицирована.

PDF Reader Pro (AppStore) - Читалка для PDF файлов на Вешем iPhone. Можно копировать, вставлять, выризать и удалять документы. Возможность просмотра документов в планшетном режиме.

Air Sharing (AppStore) - позволяет подключать iPhone к компьютеру и использовать его как сменный носитель — копировать документы (drag&drop) и просматривать их на iPhone. Форматы документов, которые можно просматривать на iPhone встроенным просмотрщиком: iWork (Pages, Numbers и Keynotes), MS Office (Word, Excel и PowerPoint), Safari Web Archive, HTML, PDF, RTF, RTFD, TXT (поддержка Unicode), Source Code (C/C++, C#, Java, JavaScript, XML, Perl, shell, Ruby, Python и др), видео iPhone (H.264, 3GPP, MP4), аудио (MP3, AAC, AIFF, WAV, CAF) и фото (GIF, JPG, PNG, TIFF). Поддержка платформ: Mac, Windows, Linux (GNOME и KDE).

QuickOffice (AppStore) - приложение, с помощью которого можно просматривать и редактировать документы Word, Excel. Так же программа поддерживает работу с Email и WiFi.

NeonPaint (AppStore) - Самая простенькая рисовалка для iPhone. Никаких лишних функций, только красивый неоновый эффект цвета. Встряхните iPhone чтобы очичстить Ваш рисунок.